1500年前，西来的高僧达摩，在嵩山面壁九年、结庐修真，创立了中土佛教禅宗的祖庭--少林寺，是少林武术的发源地，也是禅医的发源地。少林寺建寺之初。由于少林寺的皇家寺院地位，拥有良田百顷，殿宇上百间，众僧整天参禅静坐，修身养性，驱去杂念，消除思乱，镇静魂魄，安定心神。但长期静坐不动，影响了寺僧周身血液循环，造成筋络不畅，久瘀成疾。不仅影响了身体，还难以对付山林中的猛兽威胁和盗贼侵犯。于是，僧人们在学禅的同时开始习武，并充分利用嵩山丰富的药材资源，吸收民间医疗方法，不断积累用药经验，逐步形成了许多秘方。寺僧们在练武的同时，发现许多功法具有健身和医疗的双重作用，又逐步推演出了气功疗法、推拿疗法和点穴疗法。少林医学由外科而内科，由治疗跌打损伤而治疗百病，形成了独具特色的少林禅医。 据《少林武僧志》记载，僧稠禅师曾经取嵩参熬汤为跋陀补养身体。跋陀的另一位徒弟慧光也曾用铁针为一昏迷病人疗伤。禅宗二祖慧可断臂求法后在钵盂峰上养伤，寺僧们采来草药为他治疗。至达摩祖师，历代高僧在精修禅法的同时，并兼通佛教五明，而医方明最受珍视，代代相传，有言传，有秘传。