很多檀木表面都会有棕眼，小叶紫檀也不例外。用肉眼仔细观察小叶紫檀佛珠表面会有一个个凹进去的针尖大小的凹点，这就是小叶紫檀佛珠的棕眼。

小叶紫檀佛珠的棕眼是怎么形成的？这还得从小叶紫檀的木质结构说起。在显微镜下观察小叶紫檀切片，会看到一条条的管孔，这些管孔又叫脉管，是输送水分和营养的通道。这些脉管直通树干的各个角落。在加工佛珠时，这些脉管就会在佛珠表面留下的横截面就会形成一个个点，因为脉管是空的，干燥后这些脉管就会收缩，因此就会形成一个个凹点，这样就形成了我们所看到的小叶紫檀佛珠的棕眼。